中医认为关元穴为元阴元阳之气闭藏之门户，又名丹田，是统摄元气之所。关元穴是小肠的募穴，小肠之气结聚此穴，有培元固本、补益下焦之功。它为先天之气海，是养生吐纳吸气凝神的地方。古人称为人身元阴元阳交关之处；老子称之为“玄之又玄，众妙之门”。

关元穴位于脐下3寸处，一般人常用的手指比量法，即四指相并为3寸。关元穴归属于任脉，同时也作为足三阴经即足少阴肾经、足太阴脾经、足厥阴肝经及任脉的交汇处，是人体功效最强大的补穴之一。此穴还因其强大的补益功效，而被称为“千年野山参”。人参已经很补了，野人参更是大补，而千年野山参是大补中的大补。

用艾灸关元能使命门真火充盛，小肠吸收功能增加，既补气又补血，主诸虚百损。肾气禀受于先天，是维持生命活动的原动力。而此原动力，在人出生后，需要由小肠不断地吸收营养来充养，以继续发挥作用，这就是灸关元穴以后天补先天的道理。持续灸关元，可起到暖丹田、壮元阳、补肾精、益骨髓的疗效，所以是保健强身长寿穴。

用此穴还可以断生死：用指头按穴，如果指下感到无力空空，离手时，穴凹无弹力，胸下坚硬如石头，表明患者大限已到，活不久矣

关元穴还可以治疗男女不孕不育。关元穴是男子藏精，女子藏血之处。明·张景岳的《类经图翼》中记载：“主治积冷，诸虚百损，脐下绞痛渐入阴中，冷气入腹，少腹奔豚，夜梦遗精，白浊，五淋，七疝，溲血，小便赤涩，遗沥，转胞不得溺，妇人带下瘕聚，经水不通不妊，或妊娠下血，或产后恶露不止，或血冷月经断绝。一云但是积冷虚乏皆宜灸……治阴证伤寒及小便多，妇人赤白带下，俱当灸此?！?nbsp;每天灸或按摩关元穴30分钟，可治疗妇科炎症、月经不调、赤白带下、宫寒不孕、痛经闭经、子宫脱垂；对男性的前列腺炎、阳痿、小便频数亦很有效。

关元穴还可以改善失眠。失眠在中医理论中，大部分由于心肾不交所致。心在五行中属火，火性炎上。肾在五行里属水，水性延下。正常情况下，肾水能引导心火往下走，心火能温暖肾水往上营养人体。但由于工作的劳累，压力的增加，或生活的不规律，导致心火下不来，肾水上不去，而致心肾不交，出现心悸失眠。每晚灸关元穴二十分钟，可以补肾水，清心火，以治疗失眠。

关元穴因为是小肠募穴，所以用治小肠各种疾病。小肠是人体最大的消化器官，有大量的消化酶，以帮助营养的充分吸收。这些酶在一定温度下才可以发挥最大的作用，当体内有寒尤其是下焦虚冷的时候，小肠里面的温度亦下降，这时，消化酶的工作能力必然下降，势必造成营养吸收和转换的质量降低。灸关元穴其实就是提高小肠的温度，赶走寒气，促进消化酶正常工作。